Jede Behandlung ist mit Risiken und Nebenwirkungen verbunden. Die meisten Nebenwirkungen sind jedoch leicht; in seltenen Fällen können diese jedoch ernsthaft oder dauerhaft sein oder in extrem seltenen Fällen sogar lebensbedrohlich werden. Mögliche Risiken in Bezug auf die Behandlung unter Sedierung (Magenballon) oder Vollnarkose (Magenverkleinerung) bespricht der Arzt vor dem Eingriff immer mit jedem Patienten.